Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Tns3Q5SSZ5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tns3Q5SSZ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tns3Q5SSZ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tns3Q5SSZ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tns3Q5SSZ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tns3Q5SSZ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tns3Q5SSZ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tns3Q5SSZ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Tns3Q5SSZ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Tns3Q5SSZ5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tns3Q5SSZ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tns3Q5SSZ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tns3Q5SSZ5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tns3Q5SSZ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tns3Q5SSZ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Tns3Q5SSZ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tns3Q5SSZ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Tns3Q5SSZ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tns3Q5SSZ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tns3Q5SSZ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tns3Q5SSZ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Tns3Q5SSZ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Tns3Q5SSZ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Tns3Q5SSZ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tns3Q5SSZ5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tns3Q5SSZ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tns3Q5SSZ5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tns3Q5SSZ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tns3Q5SSZ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Tns3Q5SSZ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Tns3Q5SSZ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Tns3Q5SSZ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tns3Q5SSZ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Tns3Q5SSZ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tns3Q5SSZ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tns3Q5SSZ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Tns3Q5SSZ5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Tns3Q5SSZ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Tns3Q5SSZ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Tns3Q5SSZ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tns3Q5SSZ5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tns3Q5SSZ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tns3Q5SSZ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tns3Q5SSZ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tns3Q5SSZ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Tns3Q5SSZ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Tns3Q5SSZ5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Tns3Q5SSZ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tns3Q5SSZ5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tns3Q5SSZ5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tns3Q5SSZ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Tns3Q5SSZ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Tns3Q5SSZ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Tns3Q5SSZ5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tns3Q5SSZ5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Tns3Q5SSZ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Tns3Q5SSZ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tns3Q5SSZ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tns3Q5SSZ5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tns3Q5SSZ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tns3Q5SSZ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Tns3Q5SSZ5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Tns3Q5SSZ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tns3Q5SSZ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tns3Q5SSZ5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Tns3Q5SSZ5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Tns3Q5SSZ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Tns3Q5SSZ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Tns3Q5SSZ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Tns3Q5SSZ5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Tns3Q5SSZ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Tns3Q5SSZ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Tns3Q5SSZ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Tns3Q5SSZ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Tns3Q5SSZ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Tns3Q5SSZ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Tns3Q5SSZ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Tns3Q5SSZ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Tns3Q5SSZ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Tns3Q5SSZ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Tns3Q5SSZ5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Tns3Q5SSZ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Tns3Q5SSZ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Tns3Q5SSZ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Tns3Q5SSZ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Tns3Q5SSZ5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Tns3Q5SSZ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Tns3Q5SSZ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Tns3Q5SSZ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tns3Q5SSZ5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tns3Q5SSZ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Tns3Q5SSZ5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tns3Q5SSZ5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tns3Q5SSZ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tns3Q5SSZ5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tns3Q5SSZ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Tns3Q5SSZ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Tns3Q5SSZ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Tns3Q5SSZ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms