Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AbrQ5SSL4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AbrQ5SSL4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AbrQ5SSL4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AbrQ5SSL4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AbrQ5SSL4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AbrQ5SSL4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AbrQ5SSL4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AbrQ5SSL4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AbrQ5SSL4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AbrQ5SSL4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AbrQ5SSL4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AbrQ5SSL4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AbrQ5SSL4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AbrQ5SSL4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AbrQ5SSL4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AbrQ5SSL4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AbrQ5SSL4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AbrQ5SSL4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AbrQ5SSL4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AbrQ5SSL4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AbrQ5SSL4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AbrQ5SSL4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AbrQ5SSL4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AbrQ5SSL4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AbrQ5SSL4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AbrQ5SSL4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AbrQ5SSL4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AbrQ5SSL4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AbrQ5SSL4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AbrQ5SSL4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AbrQ5SSL4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms