Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRT8

Ccnjl, Cyclin-J-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjlQ5SRT8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CcnjlQ5SRT8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CcnjlQ5SRT8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CcnjlQ5SRT8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms