Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRT8

Ccnjl, Cyclin-J-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjlQ5SRT8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnjlQ5SRT8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnjlQ5SRT8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnjlQ5SRT8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcnjlQ5SRT8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CcnjlQ5SRT8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CcnjlQ5SRT8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CcnjlQ5SRT8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CcnjlQ5SRT8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms