Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc85aQ5SP85 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc85aQ5SP85 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc85aQ5SP85 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc85aQ5SP85 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc85aQ5SP85 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc85aQ5SP85 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc85aQ5SP85 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc85aQ5SP85 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc85aQ5SP85 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc85aQ5SP85 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc85aQ5SP85 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc85aQ5SP85 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc85aQ5SP85 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc85aQ5SP85 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc85aQ5SP85 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc85aQ5SP85 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc85aQ5SP85 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc85aQ5SP85 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc85aQ5SP85 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc85aQ5SP85 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc85aQ5SP85 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc85aQ5SP85 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc85aQ5SP85 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc85aQ5SP85 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc85aQ5SP85 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc85aQ5SP85 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc85aQ5SP85 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc85aQ5SP85 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc85aQ5SP85 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc85aQ5SP85 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc85aQ5SP85 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc85aQ5SP85 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc85aQ5SP85 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc85aQ5SP85 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc85aQ5SP85 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc85aQ5SP85 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc85aQ5SP85 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc85aQ5SP85 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc85aQ5SP85 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc85aQ5SP85 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc85aQ5SP85 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc85aQ5SP85 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc85aQ5SP85 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc85aQ5SP85 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc85aQ5SP85 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc85aQ5SP85 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc85aQ5SP85 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc85aQ5SP85 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc85aQ5SP85 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc85aQ5SP85 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms