Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh12Q5RJH3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh12Q5RJH3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh12Q5RJH3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh12Q5RJH3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh12Q5RJH3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh12Q5RJH3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh12Q5RJH3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh12Q5RJH3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh12Q5RJH3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh12Q5RJH3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh12Q5RJH3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh12Q5RJH3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh12Q5RJH3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh12Q5RJH3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh12Q5RJH3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh12Q5RJH3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms