Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo39Q5NBU5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo39Q5NBU5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo39Q5NBU5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo39Q5NBU5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo39Q5NBU5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo39Q5NBU5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo39Q5NBU5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo39Q5NBU5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo39Q5NBU5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo39Q5NBU5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxo39Q5NBU5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fbxo39Q5NBU5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo39Q5NBU5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbxo39Q5NBU5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fbxo39Q5NBU5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo39Q5NBU5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms