Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps41Q5KU39 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps41Q5KU39 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps41Q5KU39 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps41Q5KU39 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps41Q5KU39 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps41Q5KU39 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps41Q5KU39 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps41Q5KU39 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps41Q5KU39 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps41Q5KU39 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps41Q5KU39 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps41Q5KU39 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps41Q5KU39 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps41Q5KU39 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps41Q5KU39 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms