Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkaa1Q5EG47 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkaa1Q5EG47 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prkaa1Q5EG47 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prkaa1Q5EG47 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkaa1Q5EG47 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms