Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samt2Q497M0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samt2Q497M0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samt2Q497M0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Samt2Q497M0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samt2Q497M0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samt2Q497M0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samt2Q497M0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samt2Q497M0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samt2Q497M0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms