Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim26Q3V460 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim26Q3V460 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Smim26Q3V460 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms