Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
4930567H17RikQ3V0K5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
4930567H17RikQ3V0K5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
4930567H17RikQ3V0K5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
4930567H17RikQ3V0K5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
4930567H17RikQ3V0K5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
4930567H17RikQ3V0K5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
4930567H17RikQ3V0K5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
4930567H17RikQ3V0K5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
4930567H17RikQ3V0K5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
4930567H17RikQ3V0K5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
4930567H17RikQ3V0K5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
4930567H17RikQ3V0K5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
4930567H17RikQ3V0K5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
4930567H17RikQ3V0K5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
4930567H17RikQ3V0K5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
4930567H17RikQ3V0K5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
4930567H17RikQ3V0K5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
4930567H17RikQ3V0K5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
4930567H17RikQ3V0K5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
4930567H17RikQ3V0K5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
4930567H17RikQ3V0K5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
4930567H17RikQ3V0K5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
4930567H17RikQ3V0K5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
4930567H17RikQ3V0K5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
4930567H17RikQ3V0K5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
4930567H17RikQ3V0K5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
4930567H17RikQ3V0K5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
4930567H17RikQ3V0K5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
4930567H17RikQ3V0K5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
4930567H17RikQ3V0K5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
4930567H17RikQ3V0K5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
4930567H17RikQ3V0K5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
4930567H17RikQ3V0K5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
4930567H17RikQ3V0K5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
4930567H17RikQ3V0K5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
4930567H17RikQ3V0K5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
4930567H17RikQ3V0K5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
4930567H17RikQ3V0K5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
4930567H17RikQ3V0K5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
4930567H17RikQ3V0K5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
4930567H17RikQ3V0K5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
4930567H17RikQ3V0K5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
4930567H17RikQ3V0K5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
4930567H17RikQ3V0K5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
4930567H17RikQ3V0K5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
4930567H17RikQ3V0K5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
4930567H17RikQ3V0K5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
4930567H17RikQ3V0K5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
4930567H17RikQ3V0K5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
4930567H17RikQ3V0K5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
4930567H17RikQ3V0K5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
4930567H17RikQ3V0K5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
4930567H17RikQ3V0K5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms