Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrrfip1Q3UZ39 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrrfip1Q3UZ39 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrfip1Q3UZ39 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrfip1Q3UZ39 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrfip1Q3UZ39 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrfip1Q3UZ39 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrfip1Q3UZ39 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrfip1Q3UZ39 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrfip1Q3UZ39 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrfip1Q3UZ39 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrfip1Q3UZ39 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrfip1Q3UZ39 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrfip1Q3UZ39 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrfip1Q3UZ39 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrfip1Q3UZ39 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrfip1Q3UZ39 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrfip1Q3UZ39 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrfip1Q3UZ39 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrfip1Q3UZ39 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrfip1Q3UZ39 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrfip1Q3UZ39 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrfip1Q3UZ39 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrrfip1Q3UZ39 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrfip1Q3UZ39 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrfip1Q3UZ39 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms