Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms