Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX10

Tubal3, Tubulin alpha chain-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubal3Q3UX10 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubal3Q3UX10 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubal3Q3UX10 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubal3Q3UX10 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubal3Q3UX10 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubal3Q3UX10 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubal3Q3UX10 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubal3Q3UX10 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubal3Q3UX10 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubal3Q3UX10 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubal3Q3UX10 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubal3Q3UX10 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubal3Q3UX10 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubal3Q3UX10 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubal3Q3UX10 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubal3Q3UX10 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubal3Q3UX10 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubal3Q3UX10 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubal3Q3UX10 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubal3Q3UX10 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubal3Q3UX10 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubal3Q3UX10 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubal3Q3UX10 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubal3Q3UX10 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubal3Q3UX10 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubal3Q3UX10 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubal3Q3UX10 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubal3Q3UX10 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubal3Q3UX10 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubal3Q3UX10 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubal3Q3UX10 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubal3Q3UX10 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubal3Q3UX10 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tubal3Q3UX10 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubal3Q3UX10 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubal3Q3UX10 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubal3Q3UX10 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubal3Q3UX10 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubal3Q3UX10 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms