Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubtfl1Q3USZ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubtfl1Q3USZ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubtfl1Q3USZ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubtfl1Q3USZ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubtfl1Q3USZ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubtfl1Q3USZ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubtfl1Q3USZ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubtfl1Q3USZ2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms