Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY4

Gm10549, Predicted gene 10549 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10549Q3URY4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10549Q3URY4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10549Q3URY4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10549Q3URY4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10549Q3URY4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10549Q3URY4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm10549Q3URY4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10549Q3URY4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10549Q3URY4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm10549Q3URY4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm10549Q3URY4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm10549Q3URY4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm10549Q3URY4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm10549Q3URY4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms