Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mindy4Q3UQI9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mindy4Q3UQI9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mindy4Q3UQI9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mindy4Q3UQI9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mindy4Q3UQI9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mindy4Q3UQI9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mindy4Q3UQI9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mindy4Q3UQI9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mindy4Q3UQI9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mindy4Q3UQI9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mindy4Q3UQI9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mindy4Q3UQI9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mindy4Q3UQI9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mindy4Q3UQI9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mindy4Q3UQI9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mindy4Q3UQI9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mindy4Q3UQI9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mindy4Q3UQI9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mindy4Q3UQI9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms