Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cln5Q3UMW8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cln5Q3UMW8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cln5Q3UMW8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cln5Q3UMW8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cln5Q3UMW8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cln5Q3UMW8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cln5Q3UMW8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cln5Q3UMW8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cln5Q3UMW8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cln5Q3UMW8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cln5Q3UMW8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cln5Q3UMW8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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