Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc33Q3ULW6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc33Q3ULW6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc33Q3ULW6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc33Q3ULW6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc33Q3ULW6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc33Q3ULW6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc33Q3ULW6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc33Q3ULW6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc33Q3ULW6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc33Q3ULW6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc33Q3ULW6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc33Q3ULW6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc33Q3ULW6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc33Q3ULW6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc33Q3ULW6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc33Q3ULW6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc33Q3ULW6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc33Q3ULW6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc33Q3ULW6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc33Q3ULW6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc33Q3ULW6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc33Q3ULW6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc33Q3ULW6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc33Q3ULW6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc33Q3ULW6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc33Q3ULW6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc33Q3ULW6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc33Q3ULW6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc33Q3ULW6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc33Q3ULW6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc33Q3ULW6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc33Q3ULW6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc33Q3ULW6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc33Q3ULW6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc33Q3ULW6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc33Q3ULW6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc33Q3ULW6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc33Q3ULW6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc33Q3ULW6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc33Q3ULW6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc33Q3ULW6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc33Q3ULW6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc33Q3ULW6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc33Q3ULW6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc33Q3ULW6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc33Q3ULW6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc33Q3ULW6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc33Q3ULW6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms