Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf3bQ3ULL6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf3bQ3ULL6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf3bQ3ULL6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf3bQ3ULL6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf3bQ3ULL6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf3bQ3ULL6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf3bQ3ULL6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf3bQ3ULL6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Upf3bQ3ULL6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Upf3bQ3ULL6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Upf3bQ3ULL6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf3bQ3ULL6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Upf3bQ3ULL6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Upf3bQ3ULL6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Upf3bQ3ULL6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Upf3bQ3ULL6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Upf3bQ3ULL6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Upf3bQ3ULL6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Upf3bQ3ULL6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Upf3bQ3ULL6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Upf3bQ3ULL6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Upf3bQ3ULL6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Upf3bQ3ULL6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Upf3bQ3ULL6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Upf3bQ3ULL6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Upf3bQ3ULL6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Upf3bQ3ULL6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Upf3bQ3ULL6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Upf3bQ3ULL6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Upf3bQ3ULL6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Upf3bQ3ULL6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf3bQ3ULL6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf3bQ3ULL6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Upf3bQ3ULL6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Upf3bQ3ULL6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Upf3bQ3ULL6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Upf3bQ3ULL6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Upf3bQ3ULL6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Upf3bQ3ULL6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Upf3bQ3ULL6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Upf3bQ3ULL6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms