Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp8Q3UD82 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp8Q3UD82 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp8Q3UD82 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp8Q3UD82 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp8Q3UD82 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp8Q3UD82 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp8Q3UD82 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Parp8Q3UD82 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Parp8Q3UD82 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp8Q3UD82 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Parp8Q3UD82 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Parp8Q3UD82 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms