Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn7l3bQ3UD01 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn7l3bQ3UD01 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn7l3bQ3UD01 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn7l3bQ3UD01 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn7l3bQ3UD01 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn7l3bQ3UD01 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn7l3bQ3UD01 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn7l3bQ3UD01 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn7l3bQ3UD01 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn7l3bQ3UD01 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn7l3bQ3UD01 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn7l3bQ3UD01 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn7l3bQ3UD01 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn7l3bQ3UD01 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atxn7l3bQ3UD01 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn7l3bQ3UD01 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn7l3bQ3UD01 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn7l3bQ3UD01 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn7l3bQ3UD01 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn7l3bQ3UD01 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn7l3bQ3UD01 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atxn7l3bQ3UD01 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms