Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rufy4Q3TYX8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rufy4Q3TYX8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rufy4Q3TYX8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rufy4Q3TYX8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Rufy4Q3TYX8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rufy4Q3TYX8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rufy4Q3TYX8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rufy4Q3TYX8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rufy4Q3TYX8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rufy4Q3TYX8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rufy4Q3TYX8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rufy4Q3TYX8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rufy4Q3TYX8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rufy4Q3TYX8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rufy4Q3TYX8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rufy4Q3TYX8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rufy4Q3TYX8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rufy4Q3TYX8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rufy4Q3TYX8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rufy4Q3TYX8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Rufy4Q3TYX8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rufy4Q3TYX8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rufy4Q3TYX8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rufy4Q3TYX8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rufy4Q3TYX8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rufy4Q3TYX8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rufy4Q3TYX8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rufy4Q3TYX8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rufy4Q3TYX8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rufy4Q3TYX8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms