Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Psmd1Q3TXS7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Psmd1Q3TXS7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Psmd1Q3TXS7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Psmd1Q3TXS7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Psmd1Q3TXS7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Psmd1Q3TXS7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Psmd1Q3TXS7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psmd1Q3TXS7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psmd1Q3TXS7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psmd1Q3TXS7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psmd1Q3TXS7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Psmd1Q3TXS7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Psmd1Q3TXS7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psmd1Q3TXS7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psmd1Q3TXS7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Psmd1Q3TXS7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Psmd1Q3TXS7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Psmd1Q3TXS7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psmd1Q3TXS7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Psmd1Q3TXS7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psmd1Q3TXS7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psmd1Q3TXS7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Psmd1Q3TXS7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Psmd1Q3TXS7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Psmd1Q3TXS7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Psmd1Q3TXS7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Psmd1Q3TXS7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Psmd1Q3TXS7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Psmd1Q3TXS7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Psmd1Q3TXS7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Psmd1Q3TXS7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Psmd1Q3TXS7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Psmd1Q3TXS7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Psmd1Q3TXS7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Psmd1Q3TXS7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Psmd1Q3TXS7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Psmd1Q3TXS7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Psmd1Q3TXS7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Psmd1Q3TXS7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Psmd1Q3TXS7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Psmd1Q3TXS7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Psmd1Q3TXS7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Psmd1Q3TXS7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Psmd1Q3TXS7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Psmd1Q3TXS7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Psmd1Q3TXS7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Psmd1Q3TXS7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Psmd1Q3TXS7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Psmd1Q3TXS7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psmd1Q3TXS7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psmd1Q3TXS7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Psmd1Q3TXS7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Psmd1Q3TXS7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Psmd1Q3TXS7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Psmd1Q3TXS7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Psmd1Q3TXS7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Psmd1Q3TXS7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Psmd1Q3TXS7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Psmd1Q3TXS7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Psmd1Q3TXS7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psmd1Q3TXS7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Psmd1Q3TXS7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Psmd1Q3TXS7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psmd1Q3TXS7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psmd1Q3TXS7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psmd1Q3TXS7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psmd1Q3TXS7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psmd1Q3TXS7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psmd1Q3TXS7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Psmd1Q3TXS7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psmd1Q3TXS7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psmd1Q3TXS7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psmd1Q3TXS7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psmd1Q3TXS7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psmd1Q3TXS7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psmd1Q3TXS7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Psmd1Q3TXS7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Psmd1Q3TXS7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Psmd1Q3TXS7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Psmd1Q3TXS7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Psmd1Q3TXS7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psmd1Q3TXS7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Psmd1Q3TXS7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Psmd1Q3TXS7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Psmd1Q3TXS7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Psmd1Q3TXS7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms