Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEI4

Uncharacterized protein C15orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TEI4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TEI4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TEI4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TEI4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TEI4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TEI4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TEI4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TEI4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TEI4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3TEI4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3TEI4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3TEI4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3TEI4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3TEI4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q3TEI4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TEI4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TEI4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TEI4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3TEI4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TEI4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms