Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hp1bp3Q3TEA8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hp1bp3Q3TEA8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hp1bp3Q3TEA8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hp1bp3Q3TEA8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hp1bp3Q3TEA8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hp1bp3Q3TEA8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hp1bp3Q3TEA8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hp1bp3Q3TEA8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hp1bp3Q3TEA8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hp1bp3Q3TEA8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hp1bp3Q3TEA8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hp1bp3Q3TEA8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hp1bp3Q3TEA8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hp1bp3Q3TEA8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hp1bp3Q3TEA8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hp1bp3Q3TEA8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms