Protein–RNA interactions for Protein: Q3LS21

Kcnk9, Potassium channel subfamily K member 9, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk9Q3LS21 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnk9Q3LS21 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnk9Q3LS21 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnk9Q3LS21 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnk9Q3LS21 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnk9Q3LS21 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms