Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
V1rd19Q3KNP5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
V1rd19Q3KNP5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
V1rd19Q3KNP5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms