Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Specc1lQ2KN98 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Specc1lQ2KN98 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Specc1lQ2KN98 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Specc1lQ2KN98 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Specc1lQ2KN98 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Specc1lQ2KN98 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Specc1lQ2KN98 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Specc1lQ2KN98 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Specc1lQ2KN98 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Specc1lQ2KN98 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Specc1lQ2KN98 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Specc1lQ2KN98 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Specc1lQ2KN98 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Specc1lQ2KN98 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Specc1lQ2KN98 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Specc1lQ2KN98 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Specc1lQ2KN98 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Specc1lQ2KN98 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Specc1lQ2KN98 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Specc1lQ2KN98 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Specc1lQ2KN98 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Specc1lQ2KN98 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Specc1lQ2KN98 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Specc1lQ2KN98 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Specc1lQ2KN98 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Specc1lQ2KN98 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Specc1lQ2KN98 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Specc1lQ2KN98 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Specc1lQ2KN98 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Specc1lQ2KN98 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Specc1lQ2KN98 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Specc1lQ2KN98 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms