Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ppp4r2Q0VGB7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ppp4r2Q0VGB7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ppp4r2Q0VGB7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ppp4r2Q0VGB7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ppp4r2Q0VGB7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ppp4r2Q0VGB7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ppp4r2Q0VGB7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ppp4r2Q0VGB7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ppp4r2Q0VGB7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ppp4r2Q0VGB7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ppp4r2Q0VGB7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ppp4r2Q0VGB7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ppp4r2Q0VGB7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ppp4r2Q0VGB7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ppp4r2Q0VGB7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ppp4r2Q0VGB7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ppp4r2Q0VGB7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ppp4r2Q0VGB7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ppp4r2Q0VGB7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ppp4r2Q0VGB7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Ppp4r2Q0VGB7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ppp4r2Q0VGB7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ppp4r2Q0VGB7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ppp4r2Q0VGB7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ppp4r2Q0VGB7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ppp4r2Q0VGB7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ppp4r2Q0VGB7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ppp4r2Q0VGB7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ppp4r2Q0VGB7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ppp4r2Q0VGB7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ppp4r2Q0VGB7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ppp4r2Q0VGB7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ppp4r2Q0VGB7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ppp4r2Q0VGB7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ppp4r2Q0VGB7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ppp4r2Q0VGB7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppp4r2Q0VGB7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Ppp4r2Q0VGB7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ppp4r2Q0VGB7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ppp4r2Q0VGB7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ppp4r2Q0VGB7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ppp4r2Q0VGB7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppp4r2Q0VGB7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppp4r2Q0VGB7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ppp4r2Q0VGB7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ppp4r2Q0VGB7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms