Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tigd2Q0VBL1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tigd2Q0VBL1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tigd2Q0VBL1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tigd2Q0VBL1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tigd2Q0VBL1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tigd2Q0VBL1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tigd2Q0VBL1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tigd2Q0VBL1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tigd2Q0VBL1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tigd2Q0VBL1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tigd2Q0VBL1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tigd2Q0VBL1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tigd2Q0VBL1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tigd2Q0VBL1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tigd2Q0VBL1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tigd2Q0VBL1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tigd2Q0VBL1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tigd2Q0VBL1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tigd2Q0VBL1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tigd2Q0VBL1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tigd2Q0VBL1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tigd2Q0VBL1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tigd2Q0VBL1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tigd2Q0VBL1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms