Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem52bQ0VBF2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem52bQ0VBF2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem52bQ0VBF2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem52bQ0VBF2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms