Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SobpQ0P5V2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SobpQ0P5V2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SobpQ0P5V2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SobpQ0P5V2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SobpQ0P5V2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SobpQ0P5V2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SobpQ0P5V2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SobpQ0P5V2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SobpQ0P5V2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SobpQ0P5V2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SobpQ0P5V2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SobpQ0P5V2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SobpQ0P5V2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SobpQ0P5V2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SobpQ0P5V2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SobpQ0P5V2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SobpQ0P5V2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SobpQ0P5V2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SobpQ0P5V2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SobpQ0P5V2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SobpQ0P5V2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SobpQ0P5V2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SobpQ0P5V2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SobpQ0P5V2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SobpQ0P5V2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SobpQ0P5V2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SobpQ0P5V2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SobpQ0P5V2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SobpQ0P5V2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SobpQ0P5V2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SobpQ0P5V2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SobpQ0P5V2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SobpQ0P5V2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SobpQ0P5V2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SobpQ0P5V2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SobpQ0P5V2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SobpQ0P5V2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SobpQ0P5V2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SobpQ0P5V2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SobpQ0P5V2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SobpQ0P5V2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SobpQ0P5V2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms