Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kcnma1Q08460 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kcnma1Q08460 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kcnma1Q08460 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kcnma1Q08460 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcnma1Q08460 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcnma1Q08460 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcnma1Q08460 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcnma1Q08460 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcnma1Q08460 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcnma1Q08460 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Kcnma1Q08460 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kcnma1Q08460 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcnma1Q08460 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcnma1Q08460 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnma1Q08460 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnma1Q08460 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnma1Q08460 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnma1Q08460 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcnma1Q08460 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcnma1Q08460 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcnma1Q08460 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcnma1Q08460 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnma1Q08460 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kcnma1Q08460 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcnma1Q08460 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kcnma1Q08460 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kcnma1Q08460 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcnma1Q08460 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcnma1Q08460 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kcnma1Q08460 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kcnma1Q08460 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kcnma1Q08460 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnma1Q08460 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcnma1Q08460 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kcnma1Q08460 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kcnma1Q08460 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kcnma1Q08460 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms