Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
AmbpQ07456 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmbpQ07456 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmbpQ07456 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmbpQ07456 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AmbpQ07456 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms