Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrx2Q06348 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrx2Q06348 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrx2Q06348 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrx2Q06348 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrx2Q06348 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrx2Q06348 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrx2Q06348 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrx2Q06348 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrx2Q06348 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrx2Q06348 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrx2Q06348 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrx2Q06348 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prrx2Q06348 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrx2Q06348 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prrx2Q06348 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prrx2Q06348 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prrx2Q06348 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prrx2Q06348 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prrx2Q06348 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prrx2Q06348 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prrx2Q06348 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrx2Q06348 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrx2Q06348 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrx2Q06348 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrx2Q06348 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrx2Q06348 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrx2Q06348 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prrx2Q06348 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrx2Q06348 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrx2Q06348 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrx2Q06348 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prrx2Q06348 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrx2Q06348 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrx2Q06348 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrx2Q06348 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prrx2Q06348 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prrx2Q06348 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prrx2Q06348 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms