Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r236Q05A06 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r236Q05A06 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r236Q05A06 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r236Q05A06 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms