Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcnd1Q03719 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcnd1Q03719 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcnd1Q03719 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcnd1Q03719 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kcnd1Q03719 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kcnd1Q03719 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kcnd1Q03719 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnd1Q03719 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnd1Q03719 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnd1Q03719 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnd1Q03719 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnd1Q03719 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kcnd1Q03719 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kcnd1Q03719 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kcnd1Q03719 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnd1Q03719 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnd1Q03719 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnd1Q03719 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnd1Q03719 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kcnd1Q03719 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kcnd1Q03719 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Kcnd1Q03719 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnd1Q03719 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnd1Q03719 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms