Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crisp3Q03402 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Crisp3Q03402 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Crisp3Q03402 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Crisp3Q03402 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Crisp3Q03402 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Crisp3Q03402 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Crisp3Q03402 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Crisp3Q03402 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Crisp3Q03402 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms