Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2cQ01098 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2cQ01098 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2cQ01098 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2cQ01098 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin2cQ01098 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Grin2cQ01098 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2cQ01098 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2cQ01098 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2cQ01098 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2cQ01098 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2cQ01098 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2cQ01098 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grin2cQ01098 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2cQ01098 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2cQ01098 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2cQ01098 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2cQ01098 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2cQ01098 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2cQ01098 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2cQ01098 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin2cQ01098 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2cQ01098 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2cQ01098 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grin2cQ01098 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Grin2cQ01098 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grin2cQ01098 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grin2cQ01098 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms