Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Yy1Q00899 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Yy1Q00899 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Yy1Q00899 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Yy1Q00899 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Yy1Q00899 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Yy1Q00899 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Yy1Q00899 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Yy1Q00899 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Yy1Q00899 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Yy1Q00899 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Yy1Q00899 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Yy1Q00899 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Yy1Q00899 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Yy1Q00899 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Yy1Q00899 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Yy1Q00899 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Yy1Q00899 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Yy1Q00899 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Yy1Q00899 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Yy1Q00899 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Yy1Q00899 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Yy1Q00899 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Yy1Q00899 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Yy1Q00899 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Yy1Q00899 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Yy1Q00899 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Yy1Q00899 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Yy1Q00899 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Yy1Q00899 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Yy1Q00899 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Yy1Q00899 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Yy1Q00899 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Yy1Q00899 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Yy1Q00899 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Yy1Q00899 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Yy1Q00899 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Yy1Q00899 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Yy1Q00899 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Yy1Q00899 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Yy1Q00899 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Yy1Q00899 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Yy1Q00899 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Yy1Q00899 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Yy1Q00899 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Yy1Q00899 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Yy1Q00899 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Yy1Q00899 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Yy1Q00899 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Yy1Q00899 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Yy1Q00899 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Yy1Q00899 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Yy1Q00899 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Yy1Q00899 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Yy1Q00899 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Yy1Q00899 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms