Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scn1bP97952 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn1bP97952 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn1bP97952 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn1bP97952 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn1bP97952 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1bP97952 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1bP97952 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1bP97952 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1bP97952 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1bP97952 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn1bP97952 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn1bP97952 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn1bP97952 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Scn1bP97952 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms