Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdr2P97817 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdr2P97817 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdr2P97817 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdr2P97817 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdr2P97817 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdr2P97817 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdr2P97817 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdr2P97817 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdr2P97817 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdr2P97817 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdr2P97817 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdr2P97817 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdr2P97817 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdr2P97817 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdr2P97817 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdr2P97817 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdr2P97817 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdr2P97817 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdr2P97817 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdr2P97817 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdr2P97817 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdr2P97817 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdr2P97817 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdr2P97817 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdr2P97817 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdr2P97817 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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