Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gata5P97489 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gata5P97489 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gata5P97489 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gata5P97489 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gata5P97489 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gata5P97489 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gata5P97489 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gata5P97489 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gata5P97489 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gata5P97489 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gata5P97489 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gata5P97489 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gata5P97489 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gata5P97489 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gata5P97489 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gata5P97489 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gata5P97489 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gata5P97489 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gata5P97489 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gata5P97489 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gata5P97489 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gata5P97489 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gata5P97489 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gata5P97489 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gata5P97489 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gata5P97489 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gata5P97489 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gata5P97489 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gata5P97489 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gata5P97489 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gata5P97489 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gata5P97489 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gata5P97489 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gata5P97489 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gata5P97489 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gata5P97489 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gata5P97489 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gata5P97489 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gata5P97489 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gata5P97489 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gata5P97489 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gata5P97489 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gata5P97489 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gata5P97489 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gata5P97489 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gata5P97489 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gata5P97489 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gata5P97489 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gata5P97489 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gata5P97489 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gata5P97489 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gata5P97489 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gata5P97489 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gata5P97489 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gata5P97489 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gata5P97489 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gata5P97489 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gata5P97489 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms