Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Taf1aP97357 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf1aP97357 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1aP97357 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1aP97357 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms