Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mesp1P97309 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mesp1P97309 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mesp1P97309 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mesp1P97309 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mesp1P97309 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mesp1P97309 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Mesp1P97309 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms