Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1bP70700 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1bP70700 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1bP70700 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1bP70700 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1bP70700 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1bP70700 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1bP70700 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1bP70700 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1bP70700 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1bP70700 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1bP70700 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms