Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ufd1P70362 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ufd1P70362 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ufd1P70362 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufd1P70362 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufd1P70362 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufd1P70362 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufd1P70362 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufd1P70362 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufd1P70362 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ufd1P70362 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufd1P70362 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufd1P70362 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ufd1P70362 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ufd1P70362 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ufd1P70362 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms