Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tgif1P70284 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgif1P70284 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgif1P70284 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgif1P70284 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgif1P70284 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgif1P70284 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgif1P70284 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgif1P70284 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgif1P70284 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgif1P70284 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgif1P70284 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgif1P70284 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgif1P70284 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgif1P70284 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tgif1P70284 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgif1P70284 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgif1P70284 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgif1P70284 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgif1P70284 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgif1P70284 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgif1P70284 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgif1P70284 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgif1P70284 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgif1P70284 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgif1P70284 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgif1P70284 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgif1P70284 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgif1P70284 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgif1P70284 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgif1P70284 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgif1P70284 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgif1P70284 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgif1P70284 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgif1P70284 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tgif1P70284 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgif1P70284 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgif1P70284 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgif1P70284 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgif1P70284 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgif1P70284 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgif1P70284 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgif1P70284 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgif1P70284 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgif1P70284 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgif1P70284 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgif1P70284 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgif1P70284 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgif1P70284 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms