Protein–RNA interactions for Protein: P70178

Six5, Homeobox protein SIX5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six5P70178 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Six5P70178 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Six5P70178 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Six5P70178 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Six5P70178 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six5P70178 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six5P70178 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six5P70178 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Six5P70178 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Six5P70178 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Six5P70178 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six5P70178 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six5P70178 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six5P70178 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six5P70178 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six5P70178 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six5P70178 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six5P70178 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six5P70178 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six5P70178 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six5P70178 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six5P70178 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six5P70178 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Six5P70178 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Six5P70178 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Six5P70178 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six5P70178 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six5P70178 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six5P70178 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six5P70178 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Six5P70178 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Six5P70178 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Six5P70178 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Six5P70178 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Six5P70178 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Six5P70178 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Six5P70178 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Six5P70178 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Six5P70178 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Six5P70178 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six5P70178 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six5P70178 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Six5P70178 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Six5P70178 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Six5P70178 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Six5P70178 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Six5P70178 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Six5P70178 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Six5P70178 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six5P70178 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Six5P70178 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Six5P70178 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six5P70178 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Six5P70178 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Six5P70178 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Six5P70178 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Six5P70178 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six5P70178 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six5P70178 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six5P70178 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six5P70178 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six5P70178 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six5P70178 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six5P70178 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six5P70178 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six5P70178 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six5P70178 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six5P70178 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six5P70178 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six5P70178 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six5P70178 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Six5P70178 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Six5P70178 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Six5P70178 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Six5P70178 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Six5P70178 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Six5P70178 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Six5P70178 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Six5P70178 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Six5P70178 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Six5P70178 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six5P70178 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six5P70178 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six5P70178 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six5P70178 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Six5P70178 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Six5P70178 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Six5P70178 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Six5P70178 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Six5P70178 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Six5P70178 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Six5P70178 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Six5P70178 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Six5P70178 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Six5P70178 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Six5P70178 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Six5P70178 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Six5P70178 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Six5P70178 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Six5P70178 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms